Identifikasi bakteri tanah di Lahan Uji Terbatas pada transgenik penggerek batang menggunakan sekuens gen 16S rRNA

Siregar, Vanessa Catarina (2015) Identifikasi bakteri tanah di Lahan Uji Terbatas pada transgenik penggerek batang menggunakan sekuens gen 16S rRNA. Diploma thesis, Universitas Al Azhar Indonesia.

Text (UAI) - Published Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial. Download (0B)

Abstract

Tanaman padi adalah tanaman yang penting di sebagian besar negara Asia, termasuk di Indonesia. Padi adalah salah satu sumber makanan pokok di Indonesia, namun ketersediaan beras tidak seimbang dengan pertumbuhan penduduk yang berkembang pesat. Produksi padi membutuhkan ketersediaan lahan subur dan air, serta bebas dari hama penyakit. Peningkatan serangan hama penyakit dapat menyebabkan penurunan hasil produksi, sehingga perlu penanggulangan secara intensif salah satunya adalah introduksi tanaman padi transgenik tahan hama. Pembuatan padi transgenik penggerek batang dilakukan dengan memanfaatkan gen Cry dari bakteri Bacillus thuringiensis, dikhawatirkan tanaman transgenik akan mengeluarkan eksudat protein yang dapat mempengaruhi keanekaragaman bakteri tanah di sekitarnya. Oleh karena itu perlu dilakukan penelitian tentang identifikasi bakteri tanah dan analisis sekuens bakteri tanah di lapangan uji terbatas pada daerah Muara dan Sukamandi. Identifikasi dan analisis sekuens bakteri tanah dilakukan dengan menggunakan sekuensing (pengurutan basa) gen 16S rRNA. Tahap-tahap penelitian meliputi pengambilan sampel tanah di lapangan uji terbatas saat sebelum dan sesudah penanaman padi transgenik dan padi non transgenik (sebagai kontrol), isolasi sampel, plating pada media Nutrient Agar, Jensen, Carboxymethyl Cellulose, serta Pikovskaya, isolasi DNA genom, PCR, elektroforesis, dan sekuensing. Bakteri hasil identifikasi berasal dari beberapa genus yaitu Arthrobacter, Achromobacter, Alcaligenes, Burkholderia, Bacillus, Ochrobactrum, Pseudomonas, dan Stenotrophomonas. Penanaman padi transgenik tidak memberikan efek signifikan terhadap perubahan jumlah total bakteri berdasarkan hasil total plate count dan perubahan susunan basa pada sekuens gen 16S rRNA, baik pada lahan uji terbatas padi transgenik maupun lahan uji terbatas padi non transgenik, sehingga tidak terdapat adanya pengaruh dari eksudat oleh padi transgenik ke bakteri tanah sekitarnya

Actions (login required)

View Item