Studi pendahuluan struktur gen CRF dan HSP70 ikan sapu-sapu

Puspitasari, Riris Lindiawati and Alamsyah, Firman and Wigati, Ayuningtyas and Syavira, Azura Azka (2021) Studi pendahuluan struktur gen CRF dan HSP70 ikan sapu-sapu. Project Report. Universitas Al Azhar Indonesia, Jakarta. (Submitted)

	Text (Research Report) ILS0091-21_Isi-Laporan_Agustus-2021.pdf - Submitted Version Restricted to Registered users only Download (1MB)
	Text (Research Report) ILS0091-21_Isi-Laporan_November-2021.pdf - Submitted Version Restricted to Registered users only Download (1MB)
	Archive (Employment Contract) ILS0091-21_Surat-Perjanjian-Kerja.pdf - Supplemental Material Restricted to Registered users only Download (636kB)
	Text (Article's Content) ILS0091-21_Isi-Artikel.pdf - Draft Version Restricted to Registered users only Download (363kB)
	Image (Poster Presentation) ILS0091-21_Poster-Penelitian.pdf - Presentation Restricted to Registered users only Download (322kB)

Abstract

Ikan sapu-sapu merupakan salah satu jenis ikan yang mampu mendominasi sungai tercemar. Kondisi sungai dengan kandungan berbagai zat pencemar ternyata masih dapat mendukung pertumbuhan dan perkembangan ikan tersebut. Ikan sapu-sapu yang banyak dijumpai pada perairan sungai Ciliwung tumbuh mendominasi. Hal tersebut diduga karena ikan tersebut mampu mengontrol penyebab stress dan tidak ada predator alami. Gen yang berperan dalam mengontrol stress pada ikan adalah CRF dan HSP70. Maka dari itu, penelitian ini menggunakan ikan sapu- sapu sebagai objek untuk mengetahui stuktur gen CRF dan HSP70 sebagai gen yang berperan dalam merespon kondisi tercemar. Gen CRF dan HSP70 tersebut diisolasi melalui organ otak dan dilakukan PCR untuk dapat melihat visual dari pita DNA kedua gen tersebut. Kemudian, dilakukan sekuensing untuk dapat mengetahui urutan DNA dari gen CRF dan HSP70, sehingga dapat dianalisis struktur gen tersebut. Luaran dari penelitian ini adalah publikasi pada jurnal atau seminar internasional. Hasil sementara yang didapat yaitu sekuens HSP70 ketika diblast menunjukan hasil yang belum spesifik terhadap P. pardalis. Spesies terdekat belum ditemukan, sehingga baru dapat merujuk pada Lateolabrax maculatus dengan homologi 70% yang memang masih belum memenuhi target. Hal tersebut dapat terjadi karena belum terdapat data sekuen yang lebih mirip dengan gen HSP70 P. pardalis. Selain itu hasil sekuensing juga memperlihatkan adanya homologi sebesar 57% dengan rujukan spesies Clarias macrocephalus dari Ordo Siluriformes. Berdasarkan data tersebut maka tahapan selanjutnya direncanakan untuk mendesain ulang primer gen HSP70 lalu mengamplifikasi, dan melakukan sekuensing. Sementara itu, pada pencarian struktur gen CRF diperoleh hasil sementara yaitu berdasarkan hasil sekuensing dan perbandingan urutan yang didapat dengan data di NCBI menunjukkan belum terlihat adanya kesamaan ataupun kemiripan. Hasil tersebut mengarahkan rencana selanjutnya yaitu mendesain ulang primer CRF agar mendapatkan kedekatan dengan spesies rujukan.

Actions (login required)

View Item